AKTE HL–2026–05

ENGINE explizite Regeln · ohne ML

KLASS. TECHNISCH · ÖFFENTLICH

DOMÄNE KEIMBAHN, MENDELSCH

DATENBANKEN HPO · ClinVar · ClinGen

11 Klinik · genetische Diagnostik

Helion

Es verwandelt den Phänotyp der Patientin in einen priorisierten genetischen Testplan — Panel, Exom oder Gesamtgenom —, wobei jede Empfehlung auf eine konkrete Regel zurückführbar ist.

Expliziter Code, kein maschinelles Lernen, keine Blackboxes. Das ist keine ästhetische Haltung: Es ist das, was die Dokumentation klinischer Begründung vor einer Akkreditierung verlangt.

Wie dieses Datenblatt zu lesen ist

Jede Empfehlung kommt mit ihrer Evidenzstufe und der Version der Datenbank, die sie trägt. Ohne das ist ein Testplan eine formatierte Meinung.

19.000 Phänotypbegriffe · gerichteter Graph
2,8 M klinische Varianten · 3.500 Assoziationen

undurchsichtige Modelle in der Entscheidungskette: Jede Empfehlung ist auf eine konkrete Regel zurückführbar

19.000

Phänotypbegriffe auf einem gerichteten Graphen, mit semantischer Ähnlichkeit über den Informationsgehalt

2,8 M

klinische Varianten auf der Referenzassemblierung GRCh38

3.500

Gen-Krankheits-Assoziationen mit ihrer kuratierten Gültigkeitsstufe

Alleinstellungsmerkmal

Jede Empfehlung ist auf eine explizite Regel zurückführbar. Exomiser und Amelie — die Referenzen des Feldes — stützen ihre Priorisierung auf schwer prüfbare Modelle: Sie liefern eine geordnete Liste, aber keine Begründungskette, die ein Labor vor einer Prüferin verteidigen kann.

Hier ist das Kriterium lesbarer Code: welcher Phänotypbegriff gewogen hat, gegen welches Krankheitsprofil verglichen wurde, welche Varianten es stützen und mit welcher Prüfstufe. Dieselbe Eingabe ergibt dieselbe Ausgabe, und diese Ausgabe lässt sich Zeile für Zeile lesen.

01 Der Stand der Technik

Die Entscheidung fällt von Hand, und die Verzerrung hinterlässt keine Spur.

Bei einem komplexen Krankheitsbild ist zu entscheiden, welcher Test angefordert wird. Das zwingt dazu, Phänotypen mit Variantendatenbanken, Gen-Krankheits-Gültigkeit und publizierten Profilen zu kreuzen: ein manueller Vorgang, anfällig für Auslassungen und im Nachhinein schwer zu rekonstruieren.

Werkzeug

Wie weit es reicht

Was Helion ergänzt

Exomiser, Amelie

Sie priorisieren Gene und Varianten durch Verbindung von Phänotyp und Evidenz, mit guter publizierter Leistung.

Liefert die Argumentationskette zusammen mit der Reihenfolge: jede Entscheidung auf eine explizite Regel mit Code zurückführbar und vor einer Akkreditierung dokumentierbar.

Manuelle Suche in den klinischen Datenbanken

Das ist, was der Humangenetiker heute tut, und mit Fachurteil funktioniert es.

Überlässt dem Genetiker das Urteil und nimmt ihm die Suche ab: Er durchläuft die Datenbanken vollständig und protokolliert nachvollziehbar, warum das Verworfene verworfen wurde.

Geschlossene kommerzielle Panels

Sie decken häufige Krankheitsbilder ab, mit Herstellervalidierung und schneller Antwort.

Antwortet auch dann, wenn das Bild in kein Panel passt, und quantifiziert, was eine Eskalation zu Exom oder Genom beiträgt, damit die Entscheidung der Klinik gestützt ist.

Ein Sprachmodell fragen

Es gibt eine sofortige Antwort, die begründet wirkt.

Ist reproduzierbar und prüfbar: explizite Regeln, kein ML, mit deklarierter Version jeder Datenbank — die Bedingung dafür, dass ein Ergebnis in eine Akte eingeht.

02 Die Evidenzebenen

Nicht alles Publizierte wiegt gleich schwer.

Die Prüfstufe einer Variante in der klinischen Referenzdatenbank entscheidet, in welche Ebene sie fällt. Die drei Ebenen in einer einzigen Liste zu vermengen erzeugt Empfehlungen, die sich nicht verteidigen lassen.

Ebene 1 · klinisch

Varianten mit solider Prüfung

Jene, die die klinische Referenzdatenbank mit der höchsten Prüfstufe kennzeichnet. Das ist die Evidenz, auf der eine Empfehlung ohne Einschränkung ruhen kann.

Ebene 2 · tragfähig

Teilweise Evidenz, ausgewiesen

Varianten mit mittlerer Prüfstufe: Sie gehen in die Begründung ein, aber gekennzeichnet, und werden nie mit dem Gewicht der vorigen Ebene dargestellt.

Ebene 3 · explorativ

Ohne Prüfung, mit ihrer Gültigkeitsstufe

Ungeprüfte Varianten, begleitet von der Gen-Krankheits-Gültigkeitsstufe. Sie dienen dazu, eine Hypothese nicht aus dem Blick zu verlieren, nicht dazu, einen Test zu rechtfertigen.

Der Messer der phänotypischen Spezifität

Bevor es irgendetwas empfiehlt, misst das System, ob die eingegebenen Begriffe ausreichend trennscharf sind. Ein mit drei allgemeinen Begriffen beschriebenes Bild erlaubt keine Priorisierung, und das zu sagen ist nützlicher, als eine Rangliste zu liefern, die informativ aussieht und es nicht ist.

Die vier Domänen, der Reihe nach

Die mendelsche Keimbahn ist die gebaute Domäne. Somatisch, infektiös — wo die Verbindung zur metagenomischen Analyse entsteht — und komplex multifaktoriell sind erklärte Weiterentwicklung, keine gegenwärtige Funktion.

03 Wie es funktioniert

Vom Phänotyp zum Plan, mit dem Warum jeder Stufe.

Drei Pläne mit ihren Kosten und ihrem Umfang: gezieltes Panel, Exom oder Gesamtgenom. Die Steigerung rechtfertigt sich über die Genabdeckung der Differenzialdiagnose, nicht über Vorliebe.

Erfassung des Phänotyps

Die Begriffe des Krankheitsbildes werden über der offiziellen Ontologie gelesen, die ein gerichteter Graph ist: Ein Begriff erbt die Bedeutung seiner Vorfahren, und das zählt beim Vergleichen.

Messung der Spezifität

Vor der Priorisierung beziffert das System, ob die eingegebenen Begriffe trennen. Tun sie es nicht, sagt es das, statt eine wertlose Rangliste zu erzeugen.

Vergleich mit Krankheitsprofilen

Semantische Ähnlichkeit über den Informationsgehalt gegen die publizierten Phänotyp-Krankheits-Profile, um die Differenzialdiagnose aufzubauen.

Priorisierung der Gene

Kreuzung mit den klinischen Varianten und den Kurationen zur Gen-Krankheits-Gültigkeit, verteilt auf die drei Evidenzebenen.

Testplan

Panel, Exom oder Gesamtgenom je nach Genabdeckung der Differenzialdiagnose und verfügbarer Evidenz, mit Begründung und geschätzten Kosten jeder Option.

Plan A

Gezieltes Panel

Die Gene der wahrscheinlichsten Erkrankungen. Am günstigsten und schnellsten, wenn die Differenzialdiagnose eng ist.

Plan B

Exom

Alle kodierenden Regionen. Die Option, wenn die Differenzialdiagnose breit, aber weiterhin mendelsch ist.

Plan C

Gesamtgenom

Höchste Ausbeute und höchste Kosten. Wird vorgeschlagen, wenn die Abdeckung der vorigen Optionen einen Teil der Differenzialdiagnose auslässt.

04 Der Vertrag

Was hineingeht, was herauskommt, woran es anschließt.

Eingang

Begriffe der Ontologie menschlicher Phänotypen, die das Bild der Patientin beschreiben, mit der Fallreferenz. Keine direkte Identifizierung: Der Fall reist pseudonymisiert.

Ausgang

Rangierte Differenzialdiagnosen, Kandidatengene mit ihrer Evidenzstufe, Testempfehlung mit Begründung und Kostenschätzung sowie eine vollständige, exportierbare Prüfzeitachse des Falls.

Anschluss

Es ist bewusst ein eigenständiges Teilsystem: Sein Wissen sind die offiziellen klinischen Datenbanken, nicht der mikrobiologische Korpus der Plattform. Die infektiöse Domäne ist der Punkt, an dem die Verbindung zur metagenomischen Analyse entsteht.

05 Technisches Datenblatt

Eingang

Begriffe der Ontologie menschlicher Phänotypen mit der pseudonymisierten Fallreferenz.

Ausgabe

Rangierte Differenzialdiagnose, Kandidatengene nach Evidenzebene, empfohlener Testplan mit Begründung und Kosten sowie exportierbare Prüfzeitachse.

Prüfbarkeit

Expliziter Code von Anfang bis Ende. Weder maschinelles Lernen noch generative Modelle in der Entscheidungskette: Jeder Schritt ist eine lesbare Regel, und dieselbe Eingabe ergibt dieselbe Ausgabe.

Versionierung der Datenbanken

Jede Momentaufnahme der klinischen Datenbanken wird mit Quelle, Version und Datensatzzahl festgehalten, sodass ein alter Fall neu gedeutet werden kann im Wissen, mit welchem Kenntnisstand er gelöst wurde.

Gebaute Domäne

Mendelsche Keimbahn. Somatisch, infektiös — mit Anschluss an die metagenomische Analyse — und komplex multifaktoriell sind als Weiterentwicklung erklärt, nicht als gegenwärtige Funktion.

Grenze · Aktualisierung

Die Aktualisierung der klinischen Datenbanken erfolgt von Hand und ist noch nicht geplant. Da die Version mit dem Ergebnis reist, sagt eine Analyse immer, mit welcher Momentaufnahme sie gelöst wurde.

Grenze · Kosten

Die Kostenschätzung jedes Plans stammt aus einem festen Katalog, der dem Markt nicht folgt. Sie dient dem Vergleich der Pläne untereinander, nicht als Angebot.

Grenze · personenbezogene Daten

Der Umgang mit identifizierenden Daten ist im Modul nicht formalisiert: Pseudonymisierung und Datenschutzkonformität sind eine offene, vorrangige Anforderung vor jeder realen Anwendung in der Versorgung.

Wissensbasen: Human Phenotype Ontology mit ihren Krankheitsannotationen; ClinVar des NCBI auf der Assemblierung GRCh38; und die Gen-Krankheits-Gültigkeitskurationen von ClinGen. Semantische Ähnlichkeit über den Informationsgehalt nach Resnik. Jede Momentaufnahme einer Datenbank wird mit Datum und Datensatzzahl versioniert.

Ein Labor kann keine Blackbox verteidigen.

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