HelixCore · Precision Genomics. Unlimited Power. Die zwölf Module
AKTE HM–2026–06
STATUS MASSGEBENDER ENTWURF
KLASS. TECHNISCH · ÖFFENTLICH
MEILENSTEINE M0 → M7
NORM MIQE · dMIQE
09 Instrumentierung · qPCR und digitale PCR
Maßgebender Entwurf · im Bau

Hermes

Ein Labor will keine Rohdaten: Es will ein validiertes Positiv, Negativ oder Unbestimmt, mit Quantifizierung und Herkunft, in Sekunden. Hermes liest die Datei jedes beliebigen Thermocyclers und fällt dieses Urteil.

Es ist das Stück, das den Kreis schließt: Was in silico vorhergesagt wurde, wird mit dem abgeglichen, was das Gerät tatsächlich gemessen hat, und dieser Vergleich kehrt ins Wissen zurück, statt in einer Tabelle zu sterben.

Status
Maßgebender Entwurf, genehmigt nach drei Durchgängen geprüfter Recherche zu Formaten und Zugriffsstufen, Lizenzen, qPCR- und Schmelzmathematik sowie Kontrollregeln. Umsetzung läuft als Kette von Meilensteinen.
M0 → M7 · Meilenstein-Kette
MIQE / dMIQE als Daten, nicht als Code
Herstellerunabhängig
: jeder Echtzeit- oder digitale Thermocycler, auf ein kanonisches Modell normalisiert
8
Meilensteine, von der Dateierfassung bis zum ausgegebenen Bericht, rückwärts prüfbar
3
mögliche Urteile je Probe und Ziel: positiv, negativ oder unbestimmt, mit erklärtem Geltungsbereich
0
im Code geschriebene Schwellen: Kontrollen und Grenzwerte leben als konfigurierbare Daten
Alleinstellungsmerkmal
Herstellerunabhängig und mit dem Ansatz im Rücken. Die Software des Thermocyclers deutet, was ihre eigene Maschine gemessen hat; Hermes normalisiert die Datei jedes beliebigen Geräts auf ein kanonisches Modell und deutet sie im Wissen, wie dieser Ansatz entworfen wurde: welche Primer, welches Ziel, welche Schmelzkurvenvorhersage getroffen und welche Ausschlüsse angegeben wurden.
Diese Durchgängigkeit fehlt heute: Die gemessene Schmelzkurve wird mit der beim Entwurf vorhergesagten verglichen, die Abweichung wird zum Signal, und das Wissen des Systems verbessert sich mit jedem realen Lauf, statt im Schichtbericht zu verbleiben.
01 Der Stand der Technik

Jede Maschine ihre Software. Und das Kriterium im Kopf der Analystin.

Ein Labor mit drei Thermocyclern dreier Marken hat drei Formate, drei Schwellenkriterien und drei Berichte, die sich nicht miteinander vergleichen lassen. Die Angleichung besorgt ein Mensch von Hand.
Werkzeug
Wie weit es reicht
Was Hermes ergänzt
Die Software des Thermocyclers selbst
Sie berechnet den Schwellenzyklus und zeichnet die Kurven ihrer Maschine — dafür wird sie mitgeliefert.
Liest die Rohdatei jedes Herstellers und wendet auf alle dasselbe Kriterium an: Das Urteil reist mit dem Ergebnis, statt im Format des Geräts zu bleiben.
Die Tabelle der Analystin
Sie erlaubt es, das Kriterium des Labors anzuwenden und Läufe zu vergleichen.
Bindet das Kriterium an eine deklarierte Version: Derselbe Lauf ergibt dasselbe Urteil, und jede Revision wird im System festgehalten, statt von der Disziplin desjenigen abzuhängen, der die Tabelle pflegt.
Analysesoftware von Dritten
Sie bieten solide Mathematik für Quantifizierung und Schmelzkurve.
Analysiert den Lauf mit dem Assay-Design vor Augen: Er weiß, welche Primer das sind, wogegen sie validiert wurden und welche Ausschlüsse das Design deklarierte.
Manueller Bericht nach Norm
Er erfüllt die Publikationsleitlinie, wenn sich jemand die Mühe macht, sie auszufüllen.
Erstellt den normkonformen Bericht direkt aus den Daten, jede Kontrolle einzeln bewertet — ohne Übertragungsschritt.
02 Die Kette von Meilensteinen

Von der Gerätedatei zum unterschriftsreifen Bericht.

Acht Schritte, jeder mit Eingang und Ausgang, damit ein Urteil rückwärts bis zur Rohkurve geprüft werden kann, die es erzeugt hat.
M0
Dateierfassung
Direkter Upload oder automatische Abholung aus einem überwachten Ordner des Labors, mit Integritätsprüfung und Herstellererkennung.
M1
Normalisierung auf ein kanonisches Modell
Auswertung der Datei nach ihrer Zugriffsstufe — offenes Austauschformat, exportierte Tabelle oder proprietäres Format —, um eine einzige Darstellung des Laufs zu erzeugen.
M2
Sauberes Signal
Basislinienkorrektur und Normalisierung der Kurve, bevor irgendetwas gemessen wird, denn eine Schwelle auf einem unkorrigierten Signal misst das Rauschen.
M3
Quantifizierung
In Echtzeit: Schwellenzyklus über die zweite Ableitung und Effizienz per Regression über die exponentielle Phase. Digital: Gruppierung der Partitionen und Poisson-Korrektur.
M4
Schmelzkurve
Schmelztemperatur über die Ableitung der Fluoreszenz und Vergleich mit der beim Entwurf vorhergesagten Kurve. Die Abweichung ist Information, kein Rauschen.
M5
Qualitätskontrolle des Laufs
Validierung der Kontrollen gemäß den Publikationsleitlinien: ohne Matrize, interne Amplifikationskontrolle, positiv und ohne reverse Transkription, dazu Nachweis- und Bestimmungsgrenzen.
M6
Urteil
Positiv, negativ oder unbestimmt je Probe und Ziel, mit erklärtem Geltungsbereich. Ein ehrliches Unbestimmt ist mehr wert als ein Positiv, das nicht trägt.
M7
Ausgabe
Normgerechter Bericht, Export, Benachrichtigung über den Ereignisbus und Ablage in der Laufbibliothek des Labors.
03 Die Abgrenzung

Was Hermes tut und was anderen gehört.

Sie ist so geschrieben, dass sie sich mit nichts überschneidet: Es deutet reale Thermocycler-Läufe, Punkt. Es entwirft nicht, simuliert nicht und erfasst keine Sequenzierer.
Ja
Reale Läufe von Echtzeit- und digitalen Thermocyclern jedes Herstellers lesen und deuten.
Inkompatible Formate auf ein einziges Modell normalisieren, das den Vergleich zwischen Geräten erlaubt.
Die Kontrollen des Laufs validieren und das Urteil mit normgerechtem Bericht ausgeben.
Dem Wissen des Systems den Abgleich zwischen Vorhergesagtem und Gemessenem zurückgeben.
Nein
Es entwirft keine Primer: Das gehört SnapPrime und dem Kitgenerator.
Es macht keine In-silico-PCR: Die biophysikalische Vorhersage gehört DigiCycler.
Es erfasst keine Sequenzierer: Es nutzt die bestehende Erfassungsinfrastruktur weiter und ergänzt sie um seinen Plattformadapter.
Es erfindet keine Schwellen: Die Kontrollregeln sind kuratierte, konfigurierbare Daten, keine Konstanten im Code.
04 Technisches Datenblatt
Eingang
Export eines Echtzeit- oder digitalen Thermocyclers: offenes Austauschformat, exportierte Tabelle oder proprietäres Format, je nach Zugriffsstufe des Herstellers.
Ausgabe
Urteil je Probe und Ziel mit Quantifizierung, Bericht nach den MIQE- und dMIQE-Leitlinien, strukturierter Export und Ereignis auf dem Systembus.
Erfassung
Direkter Upload oder automatische Abholung durch einen Agenten in einem überwachten Ordner, mit Warteschlange und Integrität, unter Weiternutzung der Erfassungsinfrastruktur des Ökosystems.
Weiternutzung
Die Schmelzvorhersage des Designmoduls als Referenzkurve, die Kontrollregeln als kuratiertes Wissen und die mit den übrigen Modulen geteilte Laufbibliothek.
Nachvollziehbarkeit
Jedes Urteil lässt sich rückwärts bis zur Rohkurve und bis zum Entwurf verfolgen, der diese Primer hervorgebracht hat.
Status
Maßgebender Entwurf, im Juni 2026 genehmigt nach drei Durchgängen geprüfter Recherche zu Formaten, Lizenzen, Mathematik und Kontrollregeln. Umsetzung läuft als Kette von Meilensteinen.
Grenze · Zugriff
Der Detailgrad hängt davon ab, was jeder Hersteller exportieren lässt: Mit offenem Format wird der ganze Lauf zurückgewonnen; mit exportierter Tabelle das, was die Tabelle enthält. Der Bericht nennt, mit welcher Stufe gearbeitet wurde.
Grenze · Geltungsbereich
Hermes deutet, was das Gerät gemessen hat. Es repariert keinen schlecht entworfenen Ansatz und ersetzt keine Methodenvalidierung: Es macht schnell und mit einheitlichem Kriterium sichtbar, was der Lauf sagt.
Vollständiger Name: Harmonized Evaluation of Real-time and digital-PCR Multi-instrument Export Signals. Echtzeitquantifizierung über die zweite Ableitung und Effizienz per linearer Regression über die exponentielle Phase. Digitale PCR über Dichteschätzung und Gaußmischung mit Poisson-Korrektur. Schmelzkurve über die negative Ableitung der Fluoreszenz gegen die Temperatur, abgeglichen mit der Poland-Scheraga-Vorhersage des Designmoduls. Berichte nach den MIQE- und dMIQE-Leitlinien.

Was das Gerät gemessen hat, abgeglichen mit dem, was vorhergesagt wurde.

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