DOSSIER
HM–2026–06
ÉTAT
CONCEPTION FAISANT AUTORITÉ
CLASSIF.
TECHNIQUE · PUBLIQUE
JALONS
M0 → M7
NORME
MIQE · dMIQE
Agnostique
du fabricant : n'importe quel thermocycleur en temps réel ou numérique, normalisé vers un modèle canonique
8
jalons, de la capture du fichier au rapport émis, auditables à rebours
3
verdicts possibles par échantillon et cible : positif, négatif ou indéterminé, avec la portée déclarée
0
seuils écrits dans le code : les contrôles et les limites vivent comme donnée configurable
+
+
+
+
Ce qui le distingue
Agnostique du fabricant, et avec l'essai derrière lui. Le logiciel du thermocycleur interprète ce que sa propre machine a mesuré ; Hermes normalise le fichier de n'importe lequel vers un modèle canonique et l'interprète en sachant comment cet essai a été conçu : quelles amorces, quelle cible, quelle prédiction de courbe de fusion a été faite et quelles exclusions ont été déclarées.
Cette continuité est ce qui n'existe pas aujourd'hui : la courbe de fusion mesurée est comparée à celle prédite à la conception, l'écart devient un signal, et le savoir du système s'améliore à chaque course réelle au lieu de rester dans le rapport de poste.
01
L'état de l'art
Chaque machine, son logiciel. Et le critère, dans la tête de l'analyste.
Un laboratoire équipé de trois thermocycleurs de trois marques a trois formats, trois critères de seuil et trois rapports qui ne se comparent pas entre eux. L'harmonisation, c'est une personne qui la fait à la main.
02
La chaîne de jalons
Du fichier de l'instrument au rapport signable.
Huit étapes, chacune avec son entrée et sa sortie, pour qu'un verdict puisse être audité à rebours jusqu'à la courbe brute qui l'a produit.
M0
Capture du fichier
Téléversement direct ou collecte automatique depuis un dossier surveillé du laboratoire, avec contrôle d'intégrité et détection du fabricant.
M1
Normalisation vers un modèle canonique
Analyse du fichier selon son niveau d'accès — format ouvert d'échange, tableau exporté ou format propriétaire — pour produire une représentation unique de la course.
M2
Signal propre
Correction de ligne de base et normalisation de la courbe avant toute mesure, car un seuil posé sur un signal non corrigé mesure le bruit.
M3
Quantification
En temps réel, cycle seuil par dérivée seconde et efficacité par régression sur la phase exponentielle. En numérique, regroupement des partitions et correction de Poisson.
M4
Courbe de fusion
Température de fusion par dérivée de la fluorescence et comparaison à la courbe que la conception avait prédite. L'écart est une information, pas du bruit.
M5
Contrôle qualité de la course
Validation des contrôles conformément aux guides de publication : sans matrice, contrôle interne d'amplification, positif et sans rétrotranscription, plus limites de détection et de quantification.
M6
Verdict
Positif, négatif ou indéterminé par échantillon et cible, avec la portée déclarée. Un indéterminé honnête vaut mieux qu'un positif qui ne tient pas.
M7
Émission
Rapport conforme à la norme, export, notification par le bus d'événements et archivage dans la bibliothèque de courses du laboratoire.
03
La frontière
Ce que fait Hermes et ce qui revient aux autres.
Elle est écrite pour ne recouvrir personne : il interprète des courses réelles de thermocycleur, point. Il ne conçoit pas, ne simule pas et ne capture pas les séquenceurs.
Oui
Lire et interpréter des courses réelles de thermocycleurs en temps réel et numériques, de n'importe quel fabricant.
Normaliser des formats incompatibles vers un modèle unique qui permet de comparer entre instruments.
Valider les contrôles de la course et émettre le verdict avec son rapport conforme à la norme.
Rendre au savoir du système la confrontation entre le prédit et le mesuré.
Non
Il ne conçoit pas d'amorces : cela revient à SnapPrime et au générateur de kits.
Il ne fait pas de PCR in silico : la prédiction biophysique revient à DigiCycler.
Il ne capture pas les séquenceurs : il réutilise l'infrastructure d'ingestion existante, en ajoutant son propre adaptateur de plateforme.
Il n'invente pas de seuils : les règles de contrôle sont une donnée curée et configurable, pas des constantes dans le code.
04
Fiche technique
Entrée
Export de thermocycleur en temps réel ou numérique : format ouvert d'échange, tableau exporté ou format propriétaire, selon le niveau d'accès du fabricant.
Sortie
Verdict par échantillon et cible avec sa quantification, rapport conforme aux guides MIQE et dMIQE, export structuré et événement sur le bus du système.
Ingestion
Téléversement direct ou collecte automatique par agent sur dossier surveillé, avec file d'attente et intégrité, en réutilisant l'infrastructure d'ingestion de l'écosystème.
Réemploi
La prédiction de fusion du module de conception comme courbe de référence, les règles de contrôle comme savoir curé, et la bibliothèque de courses partagée avec les autres modules.
Traçabilité
Tout verdict peut être remonté jusqu'à la courbe brute et jusqu'à la conception qui a produit ces amorces.
État
Conception faisant autorité, approuvée en juin 2026 après trois passes de recherche vérifiée sur les formats, les licences, la mathématique et les règles de contrôle. Mise en œuvre en cours par chaîne de jalons.
Limite · accès
Le niveau de détail dépend de ce que chaque fabricant laisse exporter : avec un format ouvert, on récupère la course complète ; avec un tableau exporté, ce que le tableau contient. Le rapport déclare avec quel niveau on a travaillé.
Limite · portée
Hermes interprète ce que l'instrument a mesuré. Il ne corrige pas un essai mal conçu et ne remplace pas la validation de la méthode : il rend visible, vite et avec un critère uniforme, ce que la course dit.
Nom complet : Harmonized Evaluation of Real-time and digital-PCR Multi-instrument Export Signals. Quantification en temps réel par dérivée seconde et efficacité par régression linéaire sur la phase exponentielle. PCR numérique par estimation de densité et mélange de gaussiennes avec correction de Poisson. Courbe de fusion par dérivée négative de la fluorescence en fonction de la température, confrontée à la prédiction de Poland-Scheraga du module de conception. Rapports conformes aux guides MIQE et dMIQE.
Ce que l'instrument a mesuré, confronté à ce qui avait été prédit.
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