HelixCore · Precision Genomics. Unlimited Power. Los doce módulos
EXP. FK–2026–06
MOTOR hitos + lazo cerrado
CLASIF. TÉCNICA · PÚBLICA
FLUJO 5 toques
ÁMBITO 4 sectores
10 Entrega · producto diagnóstico

FastKit

Del propósito al kit completo en cinco toques: dices qué necesitas detectar y en qué sector, y sale el ensayo diseñado, validado in silico y documentado — protocolo, controles, tarjetas de uso y orden de compra.

Está escrito para el veterinario, el agrónomo, el perito alimentario y el clínico: el sistema habilita, no examina. Un mensaje opaco para el usuario se considera un fallo del producto, no un despiste.

Cómo leer esta ficha
El veredicto del kit nunca reclama más de lo cubierto: si un eje de exclusión exigido queda sin resolver, el sistema no lo llama específico de especie. Lo dice y lo escribe en el protocolo.
8 hitos independientes · lazo cerrado
4 ejes de exclusión declarados
5 toques
del propósito al kit: el asistente de siete pasos se sustituyó por uno de cinco
4
ejes de exclusión: filogenético, co-comercializado, flora acompañante y transferencia horizontal
8
hitos independientes, cada uno con sus pruebas de referencia aisladas
0
umbrales escritos en el código: todos vienen del perfil de requisitos y la configuración
Diferenciador único
El negativo no es una lista de parientes: es multi-eje. Lo filogenéticamente próximo, lo que se comercializa junto al producto, la flora acompañante de esa matriz y lo que viaja por transferencia horizontal. Un ensayo que sólo excluye el clado se cae con lo que comparte estantería, no con lo que comparte árbol.
Y encima, un controlador de lazo cerrado: comprueba la viabilidad antes de empezar, diagnostica por qué no sale, escala de modalidad —de un amplicón a sonda sobre variante puntual, y de ahí a varios locus— y sólo declara el nivel que los ejes cubiertos autorizan. Ningún competidor del campo —SpeciesPrimer, RUCS, varVAMP, Olivar, MFEprimer— cierra el ciclo desde la intención hasta el pedido con esa contabilidad de lo que queda sin cubrir.
01 El estado del arte

Todas terminan en el primer. El kit lo montas tú.

Convertir un par validado en algo utilizable exige calcular mezclas, redactar protocolo, hacer la tarjeta del operario, contactar proveedores y documentar para norma. Semanas de trabajo manual, y ninguna herramienta del campo entra ahí.
Herramienta
Hasta dónde llega
Lo que añade FastKit
SpeciesPrimer, RUCS, varVAMP, Olivar
Diseñan primers específicos de especie a partir de genomas, cada uno con su enfoque y buenos resultados publicados.
Amplía el negativo más allá de la filogenia: modela lo co-comercializado, la flora de la matriz y lo que viaja por transferencia horizontal — y no termina en la secuencia, sino en el kit con su dosier.
MFEprimer y validadores in silico
Comprueban la especificidad de un par ya diseñado contra bases de referencia.
Diseña, valida y documenta en la misma cadena: la decisión de qué excluir queda declarada, y el paso a producto lo da el sistema.
Kit comercial de catálogo
Llega listo, validado por el fabricante y con su documentación.
Cubre lo que no tiene catálogo: una diana propia, una matriz rara o un requisito de cliente, con la misma documentación que se espera de un kit comercial.
Encargo a un servicio externo
Resuelve el diseño con un experto humano detrás.
Entrega el resultado y el porqué: el criterio queda escrito y trazable, sin semanas de ida y vuelta ni coste por ensayo.
Montarlo en el propio laboratorio
Da control total y aprovecha el conocimiento de la casa.
Calcula las mezclas, redacta el protocolo, genera las tarjetas y prepara el dosier: el conocimiento de la casa se conserva, el trabajo manual no.
02 Los cuatro ejes del negativo

Contra qué tiene que no reaccionar tu ensayo.

El perfil de requisitos se deriva del sector y del caso de uso: qué exigir para seguridad alimentaria no es lo mismo que para sanidad vegetal o para clínica humana. Y esa exigencia se contabiliza al final.
Eje 01
Filogenético
Los parientes próximos del organismo diana, que es el eje que todo el campo cubre y el único que la mayoría cubre.
Eje 02
Co-comercializado
Lo que se vende y procesa junto al producto. Un ensayo puede ser impecable en el árbol y cruzar con lo que comparte línea de envasado.
Eje 03
Flora acompañante
La comunidad propia de esa matriz alimentaria, que es la que va a estar en el tubo aunque no sea pariente de nada.
Eje 04
Transferencia horizontal
Genes que viajan entre organismos no emparentados. Una diana portada por un elemento móvil no es específica de nadie.
La guardia de honestidad
El controlador nunca reclama especificidad de especie ni nivel máximo si alguno de los ejes exigidos por el perfil quedó sin cubrir. En vez de bajar el listón en silencio, el veredicto se emite con el alcance real y el protocolo declara qué eje no se pudo cubrir y por qué.
Escalado de modalidad
Si un amplicón único no discrimina, el sistema no se rinde ni miente: pasa a sonda sobre variante puntual y, si tampoco, a varios locus. Cada escalón encarece el ensayo y por eso se propone explicando qué se gana.
03 Cómo funciona

Ocho hitos que se pueden auditar por separado.

Cada hito es un ente independiente con su entrada, su herramienta y su salida, y con pruebas propias. No un monolito donde el fallo se diluye.
01
Intención a perfil de requisitos
Qué hay que detectar, en qué matriz y para qué sector se convierte en un perfil explícito de exigencias, derivado del corpus curado. Ese perfil es el contrato que el resultado tendrá que satisfacer.
02
Organismo a marcadores
Selección de marcadores con preferencia por genes de copia única frente al ribosómico, que discrimina peor a nivel de especie.
03
El negativo, en cuatro ejes
Construcción del conjunto de exclusión desde las bases públicas y el conocimiento curado, con una guardia que impide dar por cubierto un eje que no se pobló.
04
Ventanas por aptitud base a base
Consenso mayoritario, entropía, discriminación ponderada por eje y códigos de ambigüedad para elegir dónde se puede diseñar. La plantilla que va al diseñador es siempre la limpia, nunca la ambigua.
05
Diseño y validación termodinámica
Primers acotados a la ventana, con salida a diseño libre si no hay solución, y validación combinatoria: energía libre con peso en el extremo 3’, amplicón directo por reverso y fuera de diana por cada eje.
06
Lazo cerrado y veredicto honesto
El controlador comprueba viabilidad antes de gastar cómputo, diagnostica los fallos, escala de modalidad si hace falta y para cuando el perfil queda satisfecho — o cuando toca decir que no se puede.
07
Productización
Protocolo conforme a la guía de publicación de ensayos con el alcance y los ejes no cubiertos declarados, tarjetas de uso, ficha técnica y órdenes de compra de oligonucleótidos y reactivos.
04 El contrato

Qué entra, qué sale, con qué se encadena.

Entra
La intención en lenguaje de laboratorio —qué detectar, en qué matriz, para qué sector— y, si ya existen, los primers validados o las dianas recomendadas por los módulos anteriores.
Sale
Kit completo: protocolo bilingüe con tabla de reactivos calculada y ciclado, tarjeta de referencia rápida para el operario, ficha técnica del ensayo, dosier de validación in silico y orden de compra con especificaciones.
Encadena
Reutiliza el diseño de SnapPrime y pide segunda opinión a DigiCycler con motor independiente. Cuando el ensayo se corra de verdad, Hermes cerrará el círculo interpretando lo que midió el instrumento.
05 Ficha técnica
Sectores
Seguridad alimentaria, veterinaria, sanidad vegetal y clínica humana, cada uno con su perfil de exigencias y su modo asistido por intención.
Entrada
La intención expresada en lenguaje de laboratorio; o primers ya validados y dianas recomendadas desde los módulos anteriores.
Salida
Protocolo bilingüe con reactivos calculados y ciclado, tarjeta de operario, ficha técnica, dosier de validación in silico y orden de compra — todo exportable en PDF.
Arquitectura
Ocho hitos independientes con contrato de datos propio y pruebas de referencia aisladas, gobernados por un controlador de lazo cerrado.
Umbrales
Ninguno escrito en el código: proceden del perfil de requisitos y de la configuración del módulo, de modo que ajustar una exigencia no obliga a redesplegar.
Multi-organización
Aislamiento por organización e instalación obligatorio en todo el flujo, no como opción de despliegue.
Límite · firma
FastKit prepara el dosier técnico. La declaración de conformidad la firma el fabricante: el sistema documenta, no certifica.
Límite · in silico
La validación previa al kit es predicción biofísica. Sustituye rondas de tanteo, no la verificación experimental que exige la norma antes de poner un método en producción.
Límite · exclusión
La calidad del negativo depende de lo que haya depositado y curado para esa matriz y ese sector. Cuando un eje no se puede poblar, el kit sale con ese eje declarado como no cubierto en lugar de silenciarlo.
Diseño contrastado con el estado del arte del campo: SpeciesPrimer, RUCS, varVAMP, Olivar y MFEprimer. Normas de referencia: ISO 6579 para Salmonella, ISO 11290 para Listeria, ISO 10272 para Campylobacter, protocolos EPPO PM 7 en sanidad vegetal y marcado CE-IVD en diagnóstico humano. Protocolo emitido conforme a la guía MIQE, con declaración explícita de alcance.

Del propósito al pedido, sin cambiar de sistema.

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