HelixCore · Precision Genomics. Unlimited Power. ← Los doce módulos
EXP. HM–2026–06
ESTADO DISEÑO AUTORITATIVO
CLASIF. TÉCNICA · PÚBLICA
HITOS M0 → M7
NORMA MIQE · dMIQE
09 Instrumentación · qPCR y PCR digital
Diseño autoritativo · en construcción

Hermes

Un laboratorio no quiere datos crudos: quiere un positivo, negativo o indeterminado validado, con su cuantificación y su procedencia, en segundos. Hermes lee el fichero de cualquier termociclador y emite ese veredicto.

Es el tramo que cierra el círculo: lo que se predijo in silico se contrasta con lo que el instrumento midió de verdad, y esa comparación vuelve al conocimiento en lugar de morir en una hoja de cálculo.

Estado
Diseño autoritativo aprobado tras tres pasadas de investigación verificada sobre formatos y niveles de acceso, licencias, matemática de qPCR y fusión, y reglas de control. Implementación en curso por cadena de hitos.
M0 → M7 · cadena de hitos
MIQE / dMIQE como dato, no como código
Agnóstico
del fabricante: cualquier termociclador en tiempo real o digital, normalizado a un modelo canónico
8
hitos, de la captura del fichero al informe emitido, auditables hacia atrás
3
veredictos posibles por muestra y diana: positivo, negativo o indeterminado, con alcance declarado
0
umbrales escritos en el código: los controles y los límites viven como dato configurable
Diferenciador único
Agnóstico de fabricante y con el ensayo detrás. El programa del termociclador interpreta lo que su propia máquina midió; Hermes normaliza el fichero de cualquiera a un modelo canónico y lo interpreta sabiendo cómo se diseñó ese ensayo: qué primers, qué diana, qué predicción de curva de fusión se hizo y qué exclusiones se declararon.
Esa continuidad es lo que hoy no existe: la curva de fusión medida se compara con la predicha en el diseño, la discrepancia se convierte en señal, y el conocimiento del sistema mejora con cada carrera real en vez de quedarse en el informe del turno.
01 El estado del arte

Cada máquina, su programa. Y el criterio, en la cabeza del analista.

Cuatro pozos normalizados al modelo canónico
0 10 20 30 40
Ct 15,1 Ct 18,5 Ct 22,9 Ct 28,1
ciclos · umbral común · esquema del modelo, no una corrida
Un laboratorio con tres termocicladores de tres marcas tiene tres formatos, tres criterios de umbral y tres informes que no se comparan entre sí. La homologación la hace una persona a mano.
Herramienta
Hasta dónde llega
Lo que añade Hermes
El programa del propio termociclador
Calcula el ciclo umbral y dibuja las curvas de su máquina, que para eso viene con ella.
Lee el fichero crudo de cualquier fabricante y aplica el mismo criterio a todos: el veredicto viaja con el resultado en vez de quedarse dentro del formato de la máquina.
Hoja de cálculo del analista
Permite aplicar el criterio del laboratorio y comparar entre carreras.
Fija el criterio en una versión declarada: la misma carrera da el mismo veredicto, y cada revisión queda registrada en el sistema en vez de depender de la disciplina de quien mantiene la hoja.
Programas de análisis de terceros
Ofrecen matemática sólida de cuantificación y de curva de fusión.
Analiza la carrera con el diseño del ensayo delante: sabe qué primers son, contra qué se validaron y qué exclusiones declaraba el diseño.
Informe manual conforme a norma
Cumple la guía de publicación cuando alguien se toma el trabajo de rellenarla.
Emite el informe conforme a norma desde los propios datos, con cada control evaluado uno a uno — sin paso de transcripción.
02 La cadena de hitos

Del fichero del instrumento al informe firmable.

Ocho pasos, cada uno con su entrada y su salida, para que un veredicto pueda auditarse hacia atrás hasta la curva cruda que lo produjo.
M0
Captura del fichero
Subida directa o recogida automática desde una carpeta vigilada del laboratorio, con comprobación de integridad y detección del fabricante.
M1
Normalización a modelo canónico
Análisis del fichero según su nivel de acceso —formato abierto de intercambio, tabla exportada o formato propietario— para producir una representación única de la carrera.
M2
Señal limpia
Corrección de línea base y normalización de la curva antes de medir nada, porque un umbral sobre una señal sin corregir mide el ruido.
M3
Cuantificación
En tiempo real, ciclo umbral por segunda derivada y eficiencia por regresión sobre la fase exponencial. En digital, agrupación de particiones y corrección de Poisson.
M4
Curva de fusión
Temperatura de fusión por derivada de la fluorescencia y comparación contra la curva que el diseño predijo. La discrepancia es información, no ruido.
M5
Control de calidad de la carrera
Validación de los controles conforme a las guías de publicación: sin plantilla, interno de amplificación, positivo y sin retrotranscripción, más límites de detección y cuantificación.
M6
Veredicto
Positivo, negativo o indeterminado por muestra y diana, con el alcance declarado. Un indeterminado honesto vale más que un positivo que no se sostiene.
M7
Emisión
Informe conforme a norma, exportación, aviso por el bus de eventos y archivo en la biblioteca de carreras del laboratorio.
03 La frontera

Qué hace Hermes y qué es de otro.

Dónde viven los umbrales
control positivo dato configurable
control negativo dato configurable
límite de detección dato configurable
criterio de veredicto versión declarada
Está escrita para que no se solape con nada: interpreta carreras reales de termociclador, y punto. Ni diseña, ni simula, ni captura secuenciadores.
Sí
Leer e interpretar carreras reales de termocicladores en tiempo real y digitales, de cualquier fabricante.
Normalizar formatos incompatibles a un modelo único que permite comparar entre instrumentos.
Validar los controles de la carrera y emitir el veredicto con su informe conforme a norma.
Devolver al conocimiento del sistema el contraste entre lo predicho y lo medido.
No
No diseña primers: eso es de SnapPrime y del generador de kits.
No hace PCR in silico: la predicción biofísica es de DigiCycler.
No captura secuenciadores: reutiliza la infraestructura de ingesta ya existente, añadiendo su adaptador de plataforma.
No inventa umbrales: las reglas de control son dato curado y configurable, no constantes en el código.
04 Ficha técnica
Entrada
Exportación de termociclador en tiempo real o digital: formato abierto de intercambio, tabla exportada o formato propietario, según el nivel de acceso del fabricante.
Salida
Veredicto por muestra y diana con su cuantificación, informe conforme a las guías MIQE y dMIQE, exportación estructurada y evento en el bus del sistema.
Ingesta
Subida directa o recogida automática por agente en carpeta vigilada, con cola e integridad, reutilizando la infraestructura de ingesta del ecosistema.
Reúso
La predicción de fusión del módulo de diseño como curva de referencia, las reglas de control como conocimiento curado, y la biblioteca de carreras compartida con el resto de módulos.
Trazabilidad
Todo veredicto se puede recorrer hacia atrás hasta la curva cruda y hasta el diseño que produjo esos primers.
Estado
Diseño autoritativo aprobado en junio de 2026 tras tres pasadas de investigación verificada sobre formatos, licencias, matemática y reglas de control. Implementación en curso por cadena de hitos.
Límite · acceso
El nivel de detalle depende de lo que cada fabricante deje exportar: con formato abierto se recupera la carrera completa; con tabla exportada, lo que la tabla traiga. El informe declara con qué nivel se trabajó.
Límite · alcance
Hermes interpreta lo que el instrumento midió. No corrige un ensayo mal diseñado ni sustituye la validación del método: hace visible, deprisa y con criterio uniforme, lo que la carrera dice.
Nombre completo: Harmonized Evaluation of Real-time and digital-PCR Multi-instrument Export Signals. Cuantificación en tiempo real por segunda derivada y eficiencia por regresión lineal sobre la fase exponencial. PCR digital por estimación de densidad y mezcla de gaussianas con corrección de Poisson. Curva de fusión por derivada negativa de fluorescencia frente a temperatura, contrastada contra la predicción de Poland-Scheraga del módulo de diseño. Informes conforme a las guías MIQE y dMIQE.

Lo que el instrumento midió, contrastado con lo que se predijo.

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