HelixCore · Precision Genomics. Unlimited Power. Los doce módulos
EXP. HM–2026–06
ESTADO DISEÑO AUTORITATIVO
CLASIF. TÉCNICA · PÚBLICA
HITOS M0 → M7
NORMA MIQE · dMIQE
09 Instrumentación · qPCR y PCR digital
Diseño autoritativo · en construcción

Hermes

Un laboratorio no quiere datos crudos: quiere un positivo, negativo o indeterminado validado, con su cuantificación y su procedencia, en segundos. Hermes lee el fichero de cualquier termociclador y emite ese veredicto.

Es el tramo que cierra el círculo: lo que se predijo in silico se contrasta con lo que el instrumento midió de verdad, y esa comparación vuelve al conocimiento en lugar de morir en una hoja de cálculo.

Estado
Diseño autoritativo aprobado tras tres pasadas de investigación verificada sobre formatos y niveles de acceso, licencias, matemática de qPCR y fusión, y reglas de control. Implementación en curso por cadena de hitos.
M0 → M7 · cadena de hitos
MIQE / dMIQE como dato, no como código
Agnóstico
del fabricante: cualquier termociclador en tiempo real o digital, normalizado a un modelo canónico
8
hitos, de la captura del fichero al informe emitido, auditables hacia atrás
3
veredictos posibles por muestra y diana: positivo, negativo o indeterminado, con alcance declarado
0
umbrales escritos en el código: los controles y los límites viven como dato configurable
Diferenciador único
Agnóstico de fabricante y con el ensayo detrás. El programa del termociclador interpreta lo que su propia máquina midió; Hermes normaliza el fichero de cualquiera a un modelo canónico y lo interpreta sabiendo cómo se diseñó ese ensayo: qué primers, qué diana, qué predicción de curva de fusión se hizo y qué exclusiones se declararon.
Esa continuidad es lo que hoy no existe: la curva de fusión medida se compara con la predicha en el diseño, la discrepancia se convierte en señal, y el conocimiento del sistema mejora con cada carrera real en vez de quedarse en el informe del turno.
01 El estado del arte

Cada máquina, su programa. Y el criterio, en la cabeza del analista.

Un laboratorio con tres termocicladores de tres marcas tiene tres formatos, tres criterios de umbral y tres informes que no se comparan entre sí. La homologación la hace una persona a mano.
Herramienta
Hasta dónde llega
Lo que añade Hermes
El programa del propio termociclador
Calcula el ciclo umbral y dibuja las curvas de su máquina, que para eso viene con ella.
Lee el fichero crudo de cualquier fabricante y aplica el mismo criterio a todos: el veredicto viaja con el resultado en vez de quedarse dentro del formato de la máquina.
Hoja de cálculo del analista
Permite aplicar el criterio del laboratorio y comparar entre carreras.
Fija el criterio en una versión declarada: la misma carrera da el mismo veredicto, y cada revisión queda registrada en el sistema en vez de depender de la disciplina de quien mantiene la hoja.
Programas de análisis de terceros
Ofrecen matemática sólida de cuantificación y de curva de fusión.
Analiza la carrera con el diseño del ensayo delante: sabe qué primers son, contra qué se validaron y qué exclusiones declaraba el diseño.
Informe manual conforme a norma
Cumple la guía de publicación cuando alguien se toma el trabajo de rellenarla.
Emite el informe conforme a norma desde los propios datos, con cada control evaluado uno a uno — sin paso de transcripción.
02 La cadena de hitos

Del fichero del instrumento al informe firmable.

Ocho pasos, cada uno con su entrada y su salida, para que un veredicto pueda auditarse hacia atrás hasta la curva cruda que lo produjo.
M0
Captura del fichero
Subida directa o recogida automática desde una carpeta vigilada del laboratorio, con comprobación de integridad y detección del fabricante.
M1
Normalización a modelo canónico
Análisis del fichero según su nivel de acceso —formato abierto de intercambio, tabla exportada o formato propietario— para producir una representación única de la carrera.
M2
Señal limpia
Corrección de línea base y normalización de la curva antes de medir nada, porque un umbral sobre una señal sin corregir mide el ruido.
M3
Cuantificación
En tiempo real, ciclo umbral por segunda derivada y eficiencia por regresión sobre la fase exponencial. En digital, agrupación de particiones y corrección de Poisson.
M4
Curva de fusión
Temperatura de fusión por derivada de la fluorescencia y comparación contra la curva que el diseño predijo. La discrepancia es información, no ruido.
M5
Control de calidad de la carrera
Validación de los controles conforme a las guías de publicación: sin plantilla, interno de amplificación, positivo y sin retrotranscripción, más límites de detección y cuantificación.
M6
Veredicto
Positivo, negativo o indeterminado por muestra y diana, con el alcance declarado. Un indeterminado honesto vale más que un positivo que no se sostiene.
M7
Emisión
Informe conforme a norma, exportación, aviso por el bus de eventos y archivo en la biblioteca de carreras del laboratorio.
03 La frontera

Qué hace Hermes y qué es de otro.

Está escrita para que no se solape con nada: interpreta carreras reales de termociclador, y punto. Ni diseña, ni simula, ni captura secuenciadores.
Leer e interpretar carreras reales de termocicladores en tiempo real y digitales, de cualquier fabricante.
Normalizar formatos incompatibles a un modelo único que permite comparar entre instrumentos.
Validar los controles de la carrera y emitir el veredicto con su informe conforme a norma.
Devolver al conocimiento del sistema el contraste entre lo predicho y lo medido.
No
No diseña primers: eso es de SnapPrime y del generador de kits.
No hace PCR in silico: la predicción biofísica es de DigiCycler.
No captura secuenciadores: reutiliza la infraestructura de ingesta ya existente, añadiendo su adaptador de plataforma.
No inventa umbrales: las reglas de control son dato curado y configurable, no constantes en el código.
04 Ficha técnica
Entrada
Exportación de termociclador en tiempo real o digital: formato abierto de intercambio, tabla exportada o formato propietario, según el nivel de acceso del fabricante.
Salida
Veredicto por muestra y diana con su cuantificación, informe conforme a las guías MIQE y dMIQE, exportación estructurada y evento en el bus del sistema.
Ingesta
Subida directa o recogida automática por agente en carpeta vigilada, con cola e integridad, reutilizando la infraestructura de ingesta del ecosistema.
Reúso
La predicción de fusión del módulo de diseño como curva de referencia, las reglas de control como conocimiento curado, y la biblioteca de carreras compartida con el resto de módulos.
Trazabilidad
Todo veredicto se puede recorrer hacia atrás hasta la curva cruda y hasta el diseño que produjo esos primers.
Estado
Diseño autoritativo aprobado en junio de 2026 tras tres pasadas de investigación verificada sobre formatos, licencias, matemática y reglas de control. Implementación en curso por cadena de hitos.
Límite · acceso
El nivel de detalle depende de lo que cada fabricante deje exportar: con formato abierto se recupera la carrera completa; con tabla exportada, lo que la tabla traiga. El informe declara con qué nivel se trabajó.
Límite · alcance
Hermes interpreta lo que el instrumento midió. No corrige un ensayo mal diseñado ni sustituye la validación del método: hace visible, deprisa y con criterio uniforme, lo que la carrera dice.
Nombre completo: Harmonized Evaluation of Real-time and digital-PCR Multi-instrument Export Signals. Cuantificación en tiempo real por segunda derivada y eficiencia por regresión lineal sobre la fase exponencial. PCR digital por estimación de densidad y mezcla de gaussianas con corrección de Poisson. Curva de fusión por derivada negativa de fluorescencia frente a temperatura, contrastada contra la predicción de Poland-Scheraga del módulo de diseño. Informes conforme a las guías MIQE y dMIQE.

Lo que el instrumento midió, contrastado con lo que se predijo.

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